Выключаю, то чем редко пользуюсь, и записываю, как это включить

Выключить автостарт:
sudo update-rc.d -f apache2 remove
sudo update-rc.d -f mysqld remove

Скрипт для старта:
--------------------------------
#!/bin/sh

/etc/init.d/apache2 start
/etc/init.d/mysqld start
--------------------------------